MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782205

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014504	TTA	2	6	222	227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014504	CAAA	2	8	462	469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014504	ATT	2	6	486	491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014504	ATT	2	6	541	546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014504	ATT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014504	TTTC	2	8	615	622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014504	A	6	6	671	676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014504	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014504	GTA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014504	GGC	2	6	3996	4001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014504	T	6	6	4869	4874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014504	TCC	2	6	4917	4922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014504	AAG	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014504	T	6	6	4946	4951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014504	CGG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014504	CCT	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014504	T	6	6	4976	4981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014504	GAC	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014504	TGCT	2	8	5008	5015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014504	ATG	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014504	TTGG	2	8	5095	5102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014504	TTCA	2	8	5141	5148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014504	GA	3	6	5157	5162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014504	A	6	6	5235	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014504	CTA	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014504	AAT	2	6	5269	5274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014504	TAC	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014504	CTT	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014504	TTCA	2	8	5405	5412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014504	AGC	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014504	GATT	2	8	5542	5549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014504	AATAT	2	10	5585	5594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014504	CGTCCC	2	12	5625	5636	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014504	CCA	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014504	AAT	2	6	5729	5734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014504	ATC	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014504	ATT	2	6	6024	6029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014504	T	6	6	6028	6033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014504	CTC	2	6	12585	12590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014504	CGA	2	6	12599	12604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014504	T	7	7	12636	12642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014504	TCA	2	6	12655	12660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014504	ATT	2	6	12683	12688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014504	CTC	2	6	14587	14592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014504	TAT	2	6	14634	14639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014504	TGT	2	6	14679	14684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014504	ATG	2	6	14704	14709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014504	TAC	2	6	14751	14756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014504	AGT	2	6	14777	14782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014504	CTT	2	6	14795	14800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014504	AT	3	6	14833	14838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014504	TCA	2	6	14963	14968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014504	TGT	2	6	14982	14987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014504	TCT	2	6	15031	15036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014504	GTA	2	6	15097	15102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014504	TAA	2	6	15117	15122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014504	TGACT	2	10	15177	15186	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014504	TTA	2	6	15228	15233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014504	TCC	2	6	15268	15273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014504	CCA	2	6	15284	15289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014504	GT	3	6	15386	15391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014504	TTG	2	6	15404	15409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014504	GGA	2	6	15489	15494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014504	GTC	2	6	15502	15507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014504	AAC	2	6	15517	15522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014504	T	6	6	15544	15549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014504	TTC	2	6	15589	15594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014504	TAG	2	6	15619	15624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014504	CCT	2	6	15638	15643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014504	CCAT	2	8	15680	15687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014504	TCT	2	6	15718	15723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014504	TTG	2	6	15995	16000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014504	GTT	2	6	16074	16079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014504	CGA	2	6	16145	16150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014504	GCT	2	6	16166	16171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014504	TCA	2	6	16179	16184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014504	GATA	2	8	16236	16243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014504	CTGA	2	8	16448	16455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014504	CTA	2	6	16538	16543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014504	TTG	2	6	16556	16561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014504	CTA	2	6	16591	16596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014504	TTGC	2	8	16671	16678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014504	TGTCA	2	10	16763	16772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014504	GTT	2	6	16892	16897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014504	AG	3	6	16971	16976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014504	GAT	2	6	17020	17025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014504	TAG	2	6	17061	17066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014504	TTA	2	6	17099	17104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014504	ATT	2	6	17106	17111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014504	TAA	2	6	17113	17118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014504	TAAA	2	8	17220	17227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014504	AGA	2	6	19632	19637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014504	TGAT	2	8	19645	19652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014504	CAA	2	6	25212	25217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014504	A	7	7	25247	25253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014504	T	6	6	26258	26263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014504	TAT	3	9	26274	26282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014504	AGTT	2	8	26303	26310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014504	CTC	2	6	27163	27168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014504	A	7	7	27210	27216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014504	T	7	7	27272	27278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014504	GAAA	2	8	27289	27296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014504	CTT	2	6	27311	27316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014504	ATT	2	6	27336	27341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014504	TCAA	2	8	27356	27363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014504	ATA	2	6	27397	27402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014504	A	6	6	27778	27783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014504	CTT	2	6	27813	27818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014504	CAA	2	6	27831	27836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014504	TTG	2	6	27849	27854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014504	TA	4	8	31887	31894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014504	AAT	2	6	32874	32879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014504	A	8	8	32973	32980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014504	TGA	2	6	33083	33088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014504	CGCTA	2	10	33137	33146	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014504	CTG	2	6	33151	33156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014504	T	6	6	33209	33214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014504	A	6	6	33277	33282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014504	TGA	2	6	33301	33306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014504	GAT	2	6	33308	33313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014504	TTC	2	6	33343	33348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014504	A	8	8	33391	33398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014504	TAA	2	6	33484	33489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014504	T	7	7	33497	33503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014504	TAA	2	6	33509	33514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014504	TAA	2	6	33530	33535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014504	A	7	7	33534	33540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014504	A	6	6	33548	33553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014504	GGA	2	6	34792	34797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014504	TTA	2	6	34813	34818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014504	G	6	6	34896	34901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014504	GCG	2	6	34942	34947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014504	TTC	2	6	35064	35069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014504	CGA	2	6	35075	35080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014504	AGTA	2	8	35143	35150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014504	T	8	8	35723	35730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014504	GACT	2	8	36469	36476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014504	ATATA	2	10	36490	36499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014504	GAT	2	6	37165	37170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014504	GAA	2	6	37198	37203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014504	A	7	7	37223	37229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014504	AT	3	6	37286	37291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014504	TAAT	2	8	39871	39878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014504	CCG	2	6	39931	39936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_014504	CTC	2	6	39956	39961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_014504	A	6	6	39984	39989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014504	ATG	2	6	43576	43581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014504	AACTA	2	10	43592	43601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.